WordPress 3.1.3 ya está disponible y es una actualización de seguridad para todas las versiones anteriores. Son mejoras referente a la seguridad del sistema. Puede revisar todos los cambios en el log de cambios acá
Recuerda que puedes actualizar el sitio desde el panel de administración, como descargar la nueva versión desde el sitio principal.
Por otra parte esta disponible la segunda beta de WordPress 3.2, el cual se recomienda ser usado en sitios de prueba o desarrollos locales, y no para sitios de producción.